标题:草莓miR156靶基因SPL9的克隆与表达分析

作者:赵晓初,李贺,代红艳,刘月学,马跃,张志宏

摘要:【目的】从草莓中克隆SPL(SQUAMOSA promoter binding protein-like)转录因子基因SPL9,并分析其在草莓植株不同生长时期的表达水平及与miR156的表达关系,探讨SPL9在草莓植株生长发育中的作用。
【方法】根据苹果SPL基因家族的保守序列设计简并引物,以草莓叶片为试材,利用RT-PCR克隆草莓SPL9基因片段,在此基础上利用RACE方法克隆SPL9的cDNA全长。利用实时定量RT-PCR技术分析草莓叶片中SPL9及miR156的表达水平。
【结果】从草莓(Fragaria×ananassa)品种‘全明星’中克隆出SPL9基因的cDNA全长序列,命名为FaSPL9。其CDS长度为1 143 bp,编码381个氨基酸,与拟南芥AtSPL9、葡萄VvSPL9、枳PtSPL9、苹果MdSPL9以及玉米ZmSPL9的氨基酸序列同源性分别为:40.30%、64.57%、56.09%、70.33%,38.35%。FaSPL9有着高度保守的SBP结构域和一个双向核定位信号KRXXXRRRK。FaSPL9基因序列中包含miR156的靶位点,实时定量RT-PCR结果表明,在草莓植株的不同生长时期FaSPL9的表达量不同,且与miR156呈现相反的表达模式。
【结论】从草莓中分离出FaSPL9基因,其作为miR156的靶基因,推测FaSPL9对草莓植株的生长发育具有重要的调控作用。

关键词:草莓;SPL9;实时定量RT-PCR;miR156;

文献注录:赵晓初,李贺,代红艳,刘月学,马跃,张志宏. 草莓miR156靶基因SPL9的克隆与表达分析 [J]. 中国农业科学. 2011, 12: 2515-2522.

报/刊名:中国农业科学》,发表于2011 / 第 12 期。

文献类型: [J] (文献级别:核心刊物

页码: 2515-2522 页 / 共8

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